Características taxonómicas y funcionales de la microbiota intestinal en la enfermedad inflamatoria intestinal: revisión de alcance
DOI:
https://doi.org/10.62305/biosana.v6i4.1255Palabras clave:
microbiota intestinal; enfermedad inflamatoria intestinal; enfermedad de Crohn; colitis ulcerosa; disbiosisResumen
La enfermedad inflamatoria intestinal (EII), que comprende principalmente la enfermedad de Crohn y la colitis ulcerosa, constituye un problema creciente en la salud pública. La evidencia disponible sugiere que las alteraciones de la microbiota intestinal desempeña un papel esencial en la fisiopatología. Sin embargo, los hallazgos reportados presentan heterogeneidad en cuanto a los perfiles microbianos y sus implicaciones funcionales. El objetivo de esta revisión de alcance fue explorar la evidencia científica disponible sobre las alteraciones de la microbiota intestinal asociadas con la EII y sus principales implicaciones clínicas. Se realizó una revisión de alcance siguiendo la metodología del Joanna Briggs y la guía PRISMA – ScR. Se efectúo una búsqueda en PubMed, Scopus, ScienceDirect, SciELO de estudios originales publicados entre 2020 a 2026, incluyéndose finalmente 20 investigaciones. La evidencia mostró una disminución de bacterias productoras de ácidos grasos de cadena corta, especialmente Faecalibacterium prausnitzii y Roseburia spp. Así como un incremento de microorganismos proinflamatorios, como Escherichia coli y miembros del filo Proteobacteria, Además, los estudios reportaron una reducción de la diversidad microbiana alteraciones en rutas metabólicas relacionadas con la producción de butirato y cambios en biomarcadores microbianos asociados con la actividad de la enfermedad. En conjunto, los hallazgos evidencian una relación consistente entre la disbiosis intestinal y la EII, aunque con variabilidad en los perfiles microbiológicos descritos. La revisión identificó que la disbiosis intestinal constituye un componente relevante de la EII y respalda el potencial de la microbiota para la comprensión y el seguimiento de esta enfermedad. No obstante, la heterogeneidad metodológica entre los estudios pone de manifiesto la necesidad de investigaciones con protocolos estandarizados que permitan fortalecer la comparabilidad y la aplicabilidad de la evidencia disponible.
Descargas
Citas
Cai X, Zhou N, Zou Q, Peng Y, Xu L, Feng L, et al. Integration of taxa abundance and occurrence frequency to identify key gut bacteria correlated to clinics in Crohn's disease. BMC Microbiol. 2023;23:247. doi:10.1186/s12866-023-02999-3.
Ruan G, Sun Y, Yu Z, Bai X, Yang H, Qian J. Global, regional, and national burden of inflammatory bowel disease from 1990 to 2021: findings from the Global Burden of Disease 2021. Gastroenterol Rep (Oxf). 2025;13. doi:10.1093/gastro/goaf082
Yamamoto-Furusho JK, Parra-Holguín NN, Juliao-Baños F, Puentes F, López R, Bosques-Padilla F, et al. Clinical differentiation of inflammatory bowel disease (IBD) in Latin America and the Caribbean. Medicine (Baltimore). 2022;101(3):e28624. doi:10.1097/MD.0000000000028624.
Peralta-Castro LE, Muñoz-Palomeque SA, Peralta-Castro GP, Tapia-Cárdenas JP. Perfil clínico y epidemiológico en pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal, Cuenca-Ecuador. Rev Killkana Salud Bienestar. 2020;4(4):59-68. doi:10.26871/killcanasalud.v4i4.751.
Israr K, Naeem U, Lajia Z. Alteration of gut microbiota in inflammatory bowel disease (IBD): cause or consequence? Pathogens. 2019;8(3):126. doi:10.3390/pathogens8030126.
Caruso R, Lo BC, Chen GY, et al. Host-pathobiont interactions in Crohn's disease. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2025;22:395-414. doi:10.1038/s41575-024-00997-y.
Iliev ID, Ananthakrishnan AN, Guo CJ. Microbiota in inflammatory bowel disease: mechanisms of disease and therapeutic opportunities. Nat Rev Microbiol. 2025;23(8):509-524. doi:10.1038/s41579-025-01163-0.
Buffet-Bataillon S, Durão G, Le Huërou-Luron I, Rué O, Le Cunff Y, Cattoir V, et al. Gut microbiota dysfunction in Crohn's disease. Front Cell Infect Microbiol. 2025;15:1540352. doi:10.3389/fcimb.2025.1540352.
Alsulaiman RM, Al-Quorain AA, Al-Muhanna FA, Piotrowski S, Kurdi EA, Vatte C, et al. Gut microbiota analyses of inflammatory bowel diseases from a representative Saudi population. BMC Gastroenterol. 2023;23(1):258. doi:10.1186/s12876-023-02904-2.
Peters MDJ, Godfrey C, McInerney P, Munn Z, Tricco AC, Khalil H. Chapter 11: Scoping reviews. In: Aromataris E, Munn Z, editors. JBI Manual for Evidence Synthesis. Adelaide: JBI; 2020. doi:10.46658/JBIMES-20-12.
Tricco AC, Lillie E, Zarin W, O'Brien KK, Colquhoun H, Levac D, et al. PRISMA extension for scoping reviews (PRISMA-ScR): checklist and explanation. Ann Intern Med. 2018;169(7):467-473. doi:10.7326/M18-0850.
Hassouneh SA, Loftus M, Yooseph S. Linking inflammatory bowel disease symptoms to changes in the gut microbiome structure and function. Front Microbiol. 2021;12:673632. doi:10.3389/fmicb.2021.673632.
Amos GCA, Sergaki C, Logan A, Iriarte R, Bannaga A, Chandrapalan S, et al. Exploring how microbiome signatures change across inflammatory bowel disease conditions and disease locations. Sci Rep. 2021;11(1):18699. doi:10.1038/s41598-021-96942-z.
Serrano-Gómez G, Mayorga L, Oyarzun I, Roca J, Borruel N, Casellas F, et al. Dysbiosis and relapse-related microbiome in inflammatory bowel disease: a shotgun metagenomic approach. Comput Struct Biotechnol J. 2021;19:6481-6489. doi:10.1016/j.csbj.2021.11.037
Jiang P, Wu S, Luo Q, Zhao XM, Chen WH. Metagenomic analysis of common intestinal diseases reveals relationships among microbial signatures and powers multi-disease diagnostic models. Hum Microbiome J. 2021;6:100025. doi: 10.1128/mSystems.00112-21.
Zhou Y, He Y, Liu L, Zhou W, Wang P, Hu H, et al. Alterations in gut microbial communities across anatomical locations in inflammatory bowel diseases. Front Nutr. 2021;8:615064. doi:10.3389/fnut.2021.615064.
Tang YH, Liu HC, Song G, Wu TT, Zhao Y, Shi LJ. A case-control study on the association of intestinal flora with ulcerative colitis. AMB Express. 2021;11:106. doi:10.1186/s13568-021-01267-9.
Li W, Sun Y, Dai L, Chen H, Yi B, Niu J, et al. Ecological and network analyses identify four microbial species with potential significance for the diagnosis/treatment of ulcerative colitis (UC). BMC Microbiol. 2021;21:138. doi:10.1186/s12866-021-02201-6.
Clooney AG, Eckenberger J, Laserna-Mendieta E, Sexton KA, Bernstein MT, Vagianos K, et al. Ranking microbiome variance in inflammatory bowel disease: a large longitudinal intercontinental study. Gut. 2021;70(3):499-510. doi:10.1136/gutjnl-2020-321106.
Öhman L, Lasson A, Strömbeck A, Isaksson S, Hesselmar M, Simrén M, et al. Fecal microbiota dynamics during disease activity and remission in newly diagnosed and established ulcerative colitis. Sci Rep. 2021;11:8641. doi:10.1038/s41598-021-87973-7.
Xu X, Ocansey DKW, Hang S, Wang B, Amoah S, Yi C, et al. The gut metagenomics and metabolomics signature in patients with inflammatory bowel disease. Gut Pathog. 2022;14:26. doi:10.1186/s13099-022-00499-9.
Pisani A, Rausch P, Bang C, Ellul S, Tabone T, Marantidis Cordina C, et al. Dysbiosis in the gut microbiota in patients with inflammatory bowel disease during remission. Microbiol Spectr. 2022;10(3):e0061622. doi:10.1128/spectrum.00616-22.
Michaud E, Waeckel L, Gayet R, Goguyer-Deschaumes R, Chanut B, Jospin F, et al. Alteration of microbiota antibody-mediated immune selection contributes to dysbiosis in inflammatory bowel diseases. EMBO Mol Med. 2022;14(8):e15386. doi:10.15252/emmm.202115386.
Kang DY, Park JL, Yeo MK, Kang SB, Kim JM, Kim JS, et al. Diagnosis of Crohn's disease and ulcerative colitis using the microbiome. BMC Microbiol. 2023;23(1):336. doi:10.1186/s12866-023-03084-5.
Ning L, Zhou YL, Sun H, Zhang Y, Shen C, Wang Z, et al. Microbiome and metabolome features in inflammatory bowel disease via multi-omics integration analyses across cohorts. Nat Commun. 2023;14:7135. doi:10.1038/s41467-023-42788-0.
Basha OM, Hafez RA, Salem SM, Anis RH, Hanafy AS. Impact of gut microbiome alteration in ulcerative colitis patients on disease severity and outcome. Clin Exp Med. 2023;23(5):1763-1772. doi:10.1007/s10238-022-00917-x.
Wang H, Wang Y, Yang L, Feng J, Tian S, Chen L, et al. Integrated 16S rRNA sequencing and metagenomics insights into microbial dysbiosis and distinct virulence factors in inflammatory bowel disease. Front Microbiol. 2024;15:1375804. doi:10.3389/fmicb.2024.1375804.
Jangi S, Moyer J, Sandlow S, Fu M, Chen H, Shum A, et al. Microbial butyrate capacity is reduced in inflamed mucosa in patients with ulcerative colitis. Sci Rep. 2024;14:3479. doi:10.1038/s41598-024-54257-9.
Akiyama S, Nishijima S, Kojima Y, Kimura M, Ohsugi M, Ueki K, et al. Multi-biome analysis identifies distinct gut microbial signatures and their crosstalk in ulcerative colitis and Crohn's disease. Nat Commun. 2024;15:10291. doi:10.1038/s41467-024-54797-8.
Park H, Yeo S, Lee T, Han Y, Ryu CB, Huh CS. Culture-based characterization of gut microbiota in inflammatory bowel disease. Front Microbiol. 2025;15:1538620. doi:10.3389/fmicb.2025.1538620.
Ahmadi A, Kouhsari E, Razavi S, Mohamadzadeh N, Besharat S, Vakili MA, et al. Comparative analysis of dominant gut microbiota in inflammatory bowel disease patients and healthy individuals: a case-control study. New Microbes New Infect. 2025;64:101567. doi:10.1016/j.nmni.2025.101567.
Nishida A, Inoue R, Inatomi O, Bamba S, Naito Y, Andoh A. Gut microbiota in the pathogenesis of inflammatory bowel disease. Clin J Gastroenterol. 2018;11(1):1-10. doi:10.1007/s12328-017-0813-5.
Pandey H, Jain D, Tang DWT, Wong SH, Lal D. Gut microbiota in pathophysiology, diagnosis, and therapeutics of inflammatory bowel disease. Intest Res. 2024;22(1):15-43. doi:10.5217/ir.2023.00080.
Tharu R, Ahlawat GM, Kushwaha S, Khanna P. Gut microbiota disparities between active Crohn's disease and healthy controls: a global systematic review. Clin Epidemiol Glob Health. 2024;25:101497. doi:10.1016/j.cegh.2023.101497.
Jauregui-Amezaga A, Smet A. The microbiome in inflammatory bowel disease. J Clin Med. 2024;13(16):4622. doi:10.3390/jcm13164622.
Bajaj A, Markandey M, Kedia S, Ahuja V. Gut bacteriome in inflammatory bowel disease: an update on recent advances. Indian J Gastroenterol. 2024;43(1):103-111. doi:10.1007/s12664-024-01541-1.
Lavelle A, Sokol H. Gut microbiota-derived metabolites as key actors in inflammatory bowel disease. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2020;17(4):223-237. doi:10.1038/s41575-019-0258-z.
Guzzo GL, Mittinty MN, Llamas B, Andrews JM, Weyrich LS. Individuals with inflammatory bowel disease have an altered gut microbiome composition of fungi and protozoa. Microorganisms. 2022;10(10):1910. doi:10.3390/microorganisms10101910.
Mayorga L, Serrano-Gómez G, Xie Z, Borruel N, Manichanh C. Intercontinental gut microbiome variances in IBD. Int J Mol Sci. 2022;23(18):10868. doi:10.3390/ijms231810868.
Bhosle A, Bae S, Zhang Y, Chun E, Avila-Pacheco J, Geistlinger L, et al. Integrated annotation prioritizes metabolites with bioactivity in inflammatory bowel disease. Mol Syst Biol. 2024;20(4):338-361. doi:10.1038/s44320-024-00027-8.
Mousa WK, Al Ali A. The gut microbiome advances precision medicine and diagnostics for inflammatory bowel diseases. Int J Mol Sci. 2024;25(20):11259. doi:10.3390/ijms252011259.
Farah A, Paul P, Khan AS, Sarkar A, Laws S, Chaari A. Targeting gut microbiota dysbiosis in inflammatory bowel disease: a systematic review of current evidence. Front Med (Lausanne). 2025;12:1435030. doi:10.3389/fmed.2025.1435030.
Balderramo D, Quaresma AB, Olivera PA, Savio MC, Gimenez Villamil MP, Panaccione R, et al. Challenges in the diagnosis and treatment of inflammatory bowel disease in Latin America. Lancet Gastroenterol Hepatol. 2024;9(3):263-272. doi:10.1016/S2468-1253(23)00284-4.
Publicado
Cómo citar
Número
Sección
Licencia
Derechos de autor 2026 Revista Científica de Salud BIOSANA
Esta obra está bajo una licencia internacional Creative Commons Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0.
